玻璃房的排水和防水问题是玻璃房业主关心的问题，而玻璃屋面的防水问题特别突出。玻璃房的防水和排水是靠玻璃和杆件经过构造处理而形成，防水性能的好坏与构造组织的好坏有很大关系。

玻璃房屋面防水基本方法，归纳起来有两种：一是利用玻璃房的坡度，将顶面雨水因势利导的迅速排除，使渗漏的可能性缩到较小范围。二是利用防水材料，堵塞玻璃与杆件间的缝隙，要求无缝、无孔，以防止雨水渗漏。在这二者之间，靠前种是主要方面，防水效果好，省工、省料，因此综合处理玻璃房防水时，应以靠前种为主，第二种为辅，两者结合。不管什么形式的采光顶，排水都是十分重要的，因为如果玻璃房排水系统设计紊乱或排水的细部处理不当，造成排水不畅或积水，都是产生渗漏的因素，长期积水会使密封胶老化，所以对玻璃房的排水问题应予足够的重视。

玻璃屋面防水需要特别注意美观性。玻璃屋面往往注重透光，而且在屋内可以直接看到屋顶，防水材料的选择，防水的施工都需要注意，防水不会影响玻璃顶的美观。

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